ESTs

Comme tu l'as dit, les EST servent à identifier des gènes.

En fait il s'agit d'un outil génomique découlant de la digestion des ARNm présents dans une cellule à un moment donné. On peut les identifier facilement puisqu'on utilise un cocktail d'enzymes de restriction connu et que l'on connait la séquence des gènes ou le résultat de la digestion. Dans le cas où l'on ne connais pas la séquence du gène, on peut les obtenirs par séquençage d'ADNc obtenus à partir des ARNm de la cellule. Dans tous les cas, la taille ne dépasse pas les 1000 bases.

Une chose à préciser : à un gène peut correspondre plusieurs transcrits (à cause de l'epissage alternatif, notamment). Il y a donc beaucoup plus d'EST que de séquences codantes.

Leur utilisation principale est la détection d'expression de gène. Comme ils sont de petite taille il est plus simple de les utiliser eux pour des expériences génomiques, de type puces à ADN par exemple, plutôt que les ARNm complet qui peuvent être énormes.

Là, il y a tout plein de trucs sur les EST, mieux écrit et en anglais.

Chris et Yves