homologie hétérologie
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homologie hétérologie
Salut à tous! Une petite question concernant la génomique.
Existe-t-il une définition claire des notions d'homologie et d'hétérologie ? Ces mots sont un peu galvaudés et j'aimerai savoir ce qu'il en est !!
Thx all
Existe-t-il une définition claire des notions d'homologie et d'hétérologie ? Ces mots sont un peu galvaudés et j'aimerai savoir ce qu'il en est !!
Thx all
Quentin- Muets
- Nombre de messages : 4
Niveau et domaine de formation : master 2 BMCO en cours, licence de microbiologie
Etablissement : UCBL
Date d'inscription : 19/11/2007
Re: homologie hétérologie
Salut Quentin
Tout d'abord, permet moi de te dire que "hétérologie", ça n'existe pas en biologie (ni ailleurs, question ouverte), même si on comprend "inverse d'homologie". Pour l'homologie, je vais essayer de définir ça simplement.
La définition principale de l'homologie en biologie est le partage d'un ancêtre commun.
Dans le cas d'organes ou de structures particulières, cela veut dire que des structures homologues ont évolué à partir d'une structure unique chez un ancètre commun. Par exemple, les pattes avant des chiens, les ailes des chauve-souris et les nageoires des cétacés ont tous une origine commune, ils sont homologues.
Dans le cas de séquences nucléiques ou protéiques, la définition est la même (origine commune), même si cela fait surtout référence à la similarité entre deux séquences. Deux séquences similaires ont de fortes chances d'avoir une origine commune. Attention cependant, ce n'est surtout pas une règle absolue. Ce n'est pas parce que deux séquences sont similaires qu'elles ont une origine commune.
Quand on prend deux séquences d'ADN est qu'on les compare avec un programme d'alignement, celui-ci va nous sortir ce qu'on appelle "pourcentage d'identité" (ou de similarité) qui correspond au niveau de similarité des deux séquences. Le terme "pourcentage d'homologie" n'existe tout simplement pas : l'homologie est une qualité, pas une mesure. Deux séquences sont homologues ou ne le sont pas.
C'est seulement à partir de ce pourcentage d'identité que l'on peut poser l'hypothèse que deux séquences sont homologues. On confirmera ou infirmera cette hypothèse en retraçant l'histoire évolutive des séquences (par exemple si on la retrouve dans des espèces proches, s'il y a eu tansfert horizontal, etc...)
Deux séquences homologues peuvent être séparées par :
- un événement de spéciation : on parle de séquences orthologues.
- un événement de duplication : on parle de séquences paralogues.
En espérant avoir été clair
Yves
Tout d'abord, permet moi de te dire que "hétérologie", ça n'existe pas en biologie (ni ailleurs, question ouverte), même si on comprend "inverse d'homologie". Pour l'homologie, je vais essayer de définir ça simplement.
La définition principale de l'homologie en biologie est le partage d'un ancêtre commun.
Dans le cas d'organes ou de structures particulières, cela veut dire que des structures homologues ont évolué à partir d'une structure unique chez un ancètre commun. Par exemple, les pattes avant des chiens, les ailes des chauve-souris et les nageoires des cétacés ont tous une origine commune, ils sont homologues.
Dans le cas de séquences nucléiques ou protéiques, la définition est la même (origine commune), même si cela fait surtout référence à la similarité entre deux séquences. Deux séquences similaires ont de fortes chances d'avoir une origine commune. Attention cependant, ce n'est surtout pas une règle absolue. Ce n'est pas parce que deux séquences sont similaires qu'elles ont une origine commune.
Quand on prend deux séquences d'ADN est qu'on les compare avec un programme d'alignement, celui-ci va nous sortir ce qu'on appelle "pourcentage d'identité" (ou de similarité) qui correspond au niveau de similarité des deux séquences. Le terme "pourcentage d'homologie" n'existe tout simplement pas : l'homologie est une qualité, pas une mesure. Deux séquences sont homologues ou ne le sont pas.
C'est seulement à partir de ce pourcentage d'identité que l'on peut poser l'hypothèse que deux séquences sont homologues. On confirmera ou infirmera cette hypothèse en retraçant l'histoire évolutive des séquences (par exemple si on la retrouve dans des espèces proches, s'il y a eu tansfert horizontal, etc...)
Deux séquences homologues peuvent être séparées par :
- un événement de spéciation : on parle de séquences orthologues.
- un événement de duplication : on parle de séquences paralogues.
En espérant avoir été clair
Yves
Yves- Bavard
- Nombre de messages : 79
Age : 39
Niveau et domaine de formation : Etudiant en thèse sur l'évolution des génomes de rongeurs
Etablissement : Max-Planck-Institute, Berlin
Date d'inscription : 17/10/2007
Re: homologie hétérologie
Oki, merci bien. Il faudrait peut être dire aux "revieweur" que pourcentage d'homologie n'existe pas parcequ'on le voit partout ^^
Quentin- Muets
- Nombre de messages : 4
Niveau et domaine de formation : master 2 BMCO en cours, licence de microbiologie
Etablissement : UCBL
Date d'inscription : 19/11/2007
Re: homologie hétérologie
On veut des noms !!!
Oskar- Bavard
- Nombre de messages : 67
Niveau et domaine de formation : Doctorant Evolution et ADN ancien
Etablissement : Australian Centre for Ancient DNA, University of Adelaide
Date d'inscription : 15/10/2007
Correction
"My bad" comme on dit de l'autre coté de la manche.
Il semble que "hétérologie" existe... en français comme en anglais...
et que ça veuille bien dire l'inverse d'homologie
désolé
je le ferais plus, promis.
Il semble que "hétérologie" existe... en français comme en anglais...
et que ça veuille bien dire l'inverse d'homologie
désolé
je le ferais plus, promis.
Yves- Bavard
- Nombre de messages : 79
Age : 39
Niveau et domaine de formation : Etudiant en thèse sur l'évolution des génomes de rongeurs
Etablissement : Max-Planck-Institute, Berlin
Date d'inscription : 17/10/2007
Re: homologie hétérologie
Yves tu as édité ton post et tu as ajouté pile poil ce que je cherchais la tout de suite c'est à dire orthologue ! Tu es génial !
THX
THX
Quentin- Muets
- Nombre de messages : 4
Niveau et domaine de formation : master 2 BMCO en cours, licence de microbiologie
Etablissement : UCBL
Date d'inscription : 19/11/2007
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